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外泌体Exosomes来源于晚期核内体(也成为多囊泡体)的囊泡,几乎所有类型的细胞都能分泌外泌体,且广泛分布于血清、血浆、尿液、腹水和细胞上清等样品中。Exosomes内包含蛋白质、RNA和脂类,可参与调控重要的细胞生理活动,在免疫应答、凋亡、血管生成、炎症反应和凝结等过程中均有报道,成为多种疾病治疗的潜在靶点、早期诊断标记物、靶向药物载体等,是近年来生命科学及医学领域的重要研究热点。

服务优势

1、专利外泌体抽提技术,配合特有微量RNA建库方法,提供miRNA测序整体服务
2、采用3个外泌体或囊泡数据库,注释信息更完善,为深入挖掘结果提供佐证
3、提供肿瘤研究的临床数据分析,使得分析结果更加饱满
4、4个最新数据库预测靶基因,结果更准确

外泌体中miRNA常见功能

Small RNA主要包含miRNA、piRNA、tsRNA和snoRNA等RNA分子。小RNA参与基因表达与调控、RNA的加工与剪切、蛋白质翻译、遗传“入侵”抑制、配子发生等重要生物学过程,是生命活动中不可少的调控因子。微小RNA(microRNA,简称miRNA)是小RNA的最主要部分,已被证明与包括癌症、心血管疾病、免疫系统疾病在内的多种疾病密切相关。如:miRNA可以被外泌体运输到其他细胞组织,为癌细胞转移创造合适的微环境,从而促进癌细胞转移。此外,外泌体miRNA也可以作为疾病的生物标志物,广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。高通量测序技术可以在单次测序中获得样品中所有小RNA的序列信息,从而分析不同疾病状态、不同样品来源、不同处理条件下小RNA的表达水平,并精确比较其之间的小RNA表达差异,从而为后续研究小RNA的生物学意义提供指引。

外泌体研究全面技术路线

高通量测序与分析流程

生物信息学分析项目

测序类型基本分析高级分析
外泌体小RNA测序1、 数据质量评估及QC
2、 序列比对
3、 全基因组Reads分布图谱
4、 ncRNA分类与注释
5、 已知miRNA分析
    5.1 已知miRNA表达量
    5.2 已知miRNA整体表达量分析
    5.3已知miRNA长度
    5.4 已知miRNA碱基偏好性分析
6、 基因组重复区域注释
7、 功能元件注释
8、 新miRNA预测
9、 共有及特有序列分析
10、 样品间miRNA表达差异分析
11、 miRNA家族分析(仅限于模式物种)
12、 miRNA保守性分析(仅限于模式物种)
13、 miRNA碱基编辑分析
14、 样品间相关性分析
15、 样品间主成份分析
16、 差异表达miRNA靶基因预测(已知miRNA,仅限于人/大鼠/小鼠三个物种)
    16.1 miRNA基本信息
    16.2 靶基因预测方法介绍
    16.3 靶基因预测结果
    16.4 候选靶基因
17、 差异表达miRNA靶基因的KEGG通路富集分析
18、 差异表达miRNA靶基因的GO功能富集分析
1、 miRNA靶基因预测(非模式物种或新miRNA)
2、 新miRNA差异表达分析
3、 miRNA疾病数据库注释(仅限于人)
4、 外泌体数据库注释(仅限于人/大鼠/小鼠三个物种)
tsRNA分析
1、 tsRNA来源分析
2、 tsRNA表达量分析
3、 ts差异分析
4、 tsRNA表达聚类分析

常见问题

1.没有参考基因组的物种,或miRBase没有参考物种的miRNA序列,可以做外泌体Small RNA测序吗?

无参考基因组的物种可以先做无参转录组拼接转录本,以转录本作为参考序列用于Small RNA测序分析,或用近缘物种的基因组作为参考;miRBase没有收录待研究物种的miRNA序列,可用近缘物种的miRNA序列进行注释。

2. 外泌体收样有哪些注意事项?

分离exosomes前的样品不能加入任何RNA保护剂(如TRIzol,RNAlater)。
血清样品采血后,轻轻将全血滴入洁净的EP管或者离心管;4℃下静置3~4小时,可见血块析出;再进行离心。血浆样品不能用肝素抗凝,用采血针和EDTA抗凝管抽取全血混匀;4℃下静置3~4小时,再离心取上清。细胞上清样品在细胞培养环节需采用去除exosomes的血清,且避免支原体污染。更详细的样品收集步骤请参考《收样流程》。

3.送样有哪些要求?
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