产品
  • 产品
  • 内容
  • 购物车里没有产品
选择页面
服务热线: 400-686-0075

全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)被视为DNA甲基化研究的“金标准”,结合重亚硫酸盐(Bisulfite)处理和高通量测序技术,实现全基因组范围内单个C碱基的甲基化分析,适用于全基因组精细甲基化图谱的构建。

通过研究DNA甲基化与肿瘤、神经变性疾病和自身免疫性疾病等的相关性,以及胚胎发育、基因印迹和X染色体失活等过程,探讨表观遗传学研究的重要意义。

服务优势

● 平台完整:从样本处理、建库、测序到生物信息学分析提供一站式优秀服务
● 精确度高:成熟的甲基化转化处理技术,精确实现单个C碱基甲基化状态分析
● 覆盖范围广:可在全基因组水平上实现甲基化位点检测
● 重复性好:稳定处理,适用于多样本间的比较分析

项目流程

生物信息学分析项目

测序类型基本分析高级分析
WGBS测序
(有参考基因组)
1、 数据质量评估及QC
2、 基因组比对
3、 测序深度及覆盖度统计
4、 数据的可视化
5、 甲基化检测质控
6、 甲基化位点检测及统计
7、 甲基化位点附近序列特征检测
8、 样品间相关性分析
9、 PCA分析
10、 差异甲基化位点(DMS)分析
11、 差异甲基化区域(DMR)分析
    11.1 DMR鉴定结果统计
    11.2 DMR结构注释
    11.3 DMR基因GO富集分析(仅限模式物种)
    11.4 DMR基因KEGG富集分析(仅限模式物种)
12、 差异甲基化启动子(DMP)分析
    12.1 差异甲基化启动子(DMP)统计(仅限模式物种)
    12.2 DMP聚类分析(仅限模式物种)
    12.3 DMP 基因GO富集分析(仅限模式物种)
    12.4 DMP基因KEGG富集分析(仅限模式物种)
1、 甲基化数据SNP检测
2、 肿瘤纯度分析
3、 甲基化转录因子鉴定
4、 与其他测序数据关联分析

常见问题

1. 哪些物种可以开展WGBS研究?

目前主要开展拥有完整基因组序列(拼接到染色体水平)和完整基因注释文件(包含基因水平,有外显子、内含子、CDS等)的真核生物,特殊情况建议反馈物种拉丁名进行项目评估。

2. WGBS项目mapping rate相对其他项目低?

WGBS建库过程中,Bisulfite处理将umC转化为U,mC维持不变。PCR扩增后,所有mC不受影响,而umC变成T,互补链就变成A;初始的双链DNA就变成了四条不同的链。采用Bismark软件与参考基因组进行比对,将所有参考基因组和reads上的C变成T(另一条链G变成A),导致mismapping 的碱基位点较多,mapping rate降低。

3.不同甲基化测序方法比较的优缺点?
QQ客服
官方微信
联系电话

服务热线

400-686-0075